L’effet secondaire le plus fréquent est l’effet des variations de pression sur l’oreille moyenne. Il n’est pas dangereux et peut être évité en apprenant les techniques d’équilibrage de la pression. Les autres effets secondaires sont rares : barotraumatisme pulmonaire, toxicité de l’oxygène (poumons et cerveau), claustrophobie (peur des espaces clos) et myopie transitoire. Afin de prévenir les effets secondaires, chaque patient doit être examiné avant le traitement par un médecin spécialiste en médecine hyperbare. Le médecin responsable peut alors prendre les mesures nécessaires et adapter le traitement en conséquence.
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